Certifier et sécuriser vos comptes annuels.
Audit légal de SELARL et SELAS, audit contractuel avant cession ou acquisition, contrôle interne volontaire : la fiabilité de vos comptes par un cabinet 100 % spécialisé pharmacie d'officine.
Six missions pour auditer et certifier vos comptes d'officine.
De la certification légale annuelle à l'audit pré-cession, voici ce que comprend notre accompagnement complet en audit et commissariat aux comptes pour les pharmacies d'officine.
Certification légale des comptes annuels.
Mission de commissariat aux comptes pour SELARL et SELAS dépassant les seuils légaux. Vérification de la sincérité et de l'image fidèle des comptes, rapport présenté à l'Assemblée Générale.
Audit pré-cession et fiabilisation.
Audit contractuel commandé par le cédant avant mise en vente : retraitement des comptes, calcul de l'EBE normatif, valorisation indépendante, sécurisation du dossier face aux repreneurs.
Audit d'acquisition et due diligence.
Audit côté acquéreur avant signature : vérification de la rentabilité réelle, détection des risques fiscaux, valorisation indépendante et recommandations chiffrées pour la négociation.
Audit interne et contrôle qualité.
Audit volontaire ponctuel sur des postes ciblés : marge brute par famille thérapeutique, tiers-payant et délais d'encaissement, masse salariale, rotation de stock et péremptions.
Audit fiscal préventif officine.
Vérification de la ventilation TVA multi-taux (2,1 / 10 / 20 %), traitement du tiers-payant, cohérence CVAE / CFE, charges déductibles, traitement des dividendes mère-fille pour SPFPL.
Audit des opérations exceptionnelles.
Commissaire aux apports et à la fusion sur les opérations de restructuration : transformation EI vers SEL, apport de titres en SPFPL, fusion d'officines, augmentation de capital.
Une mission d'audit adaptée à votre situation.
Échangeons 30 minutes pour identifier le type d'audit pertinent selon votre forme juridique et votre projet.
CAC obligatoire, audit contractuel ou audit volontaire : laquelle ?
Selon votre forme juridique, votre taille et votre projet, la mission d'audit qui vous correspond n'est pas la même. Voici les caractéristiques techniques et juridiques des 3 types d'audit pour une officine.
| Critère | CAC obligatoire Légal | Audit contractuel Pré-cession | Audit volontaire Interne |
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Caractère de la mission
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Obligation légale
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Contractuel
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Volontaire
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Cible principale
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SELARL / SELAS dépassant seuils
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Cédants et acquéreurs
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Toute forme juridique
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Quand la déclencher
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Dépassement de 2 / 3 seuils
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12-18 mois avant cession
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Tous les 2 à 3 ans
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Durée de la mission
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6 exercices renouvelables
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Mission ponctuelle
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Mission ponctuelle
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Normes appliquées
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NEP / ISA obligatoires
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NEP + usages M&A
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Méthodologie sectorielle
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Livrable produit
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Rapport certifiant annuel
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Rapport de négociation
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Rapport recommandations
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Périmètre d'analyse
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Comptes annuels complets
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Comptes + valorisation
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Postes ciblés au choix
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Bénéfice principal
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Conformité légale
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Sécuriser la transaction
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Détecter les dérives
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Source : référentiel Pharmaly 2026 — Caractéristiques observées sur les missions d'audit d'officine.
Les 3 types d'audit ne sont pas exclusifs : une SELARL dépassant les seuils peut aussi commander un audit contractuel en complément, par exemple en préparation de cession. À l'inverse, un audit volontaire peut révéler des points justifiant la mise en place d'une mission CAC légale plus complète. Nous cadrons la mission selon votre besoin réel.
Quelle mission d'audit pour votre situation ?
Échangeons 30 minutes pour identifier le type d'audit pertinent selon votre forme juridique, vos seuils et votre projet.
Cinq étapes claires, de votre premier appel à votre premier bilan.
Un processus structuré et transparent : vous savez exactement ce qui se passe à chaque moment, qui fait quoi, et combien de temps ça prend.
Premier échange
Appel de 30 minutes pour comprendre votre structure juridique, votre CA et vos projets à 1-3 ans.
Devis et lettre de mission
Sous 48 h, vous recevez une proposition forfaitaire annuelle conforme aux normes OEC.
Reprise de dossier
Reprise balance, à-nouveaux et connexion à votre LGO (Winpharma, LGPI, Smart Rx).
Tenue et tableaux de bord
Premier tableau de bord avec EBE, marge brute, ratio frais de personnel et alertes.
Bilan et liasse fiscale
Bilan annuel, liasse fiscale (2065, 2050 ou 2035) et rendez-vous d'analyse stratégique.
Prêt à démarrer la première étape ?
30 minutes pour comprendre votre situation et envisager les pistes concrètes pour votre officine.
Quatre moments où un audit change la trajectoire d'une officine.
L'audit n'est pas une mission de routine que l'on subit chaque année. Dans la vie d'une officine, il existe quatre moments précis où la valeur ajoutée d'un audit, légal ou contractuel, devient décisive.
01 Au moment où votre SELARL franchit les seuils légaux
Le premier moment-clé est mécanique. Dès que votre SELARL ou SELAS dépasse 2 des 3 seuils sur 2 exercices consécutifs (5 M€ de total bilan, 10 M€ de CA HT, 50 salariés), la nomination d'un commissaire aux comptes devient obligatoire. Le mandat est de 6 exercices, renouvelable, et fait l'objet d'une décision en Assemblée Générale.
Beaucoup de dirigeants découvrent cette obligation tardivement, parfois au moment du dépôt des comptes ou à la suite d'une remarque du greffe. Anticiper la nomination du CAC permet de choisir le bon prestataire, plutôt que d'avoir à improviser dans l'urgence. C'est aussi l'occasion de fiabiliser durablement vos comptes et vos procédures internes.
02 Avant de mettre votre officine sur le marché
Un audit pré-cession, mené 12 à 18 mois avant la mise en vente, change profondément la valorisation finale. Le travail consiste à retraiter l'EBE pour faire apparaître la rentabilité réelle (rémunération du titulaire, charges exceptionnelles, ajustements de masse salariale), à fiabiliser les marges par famille thérapeutique et à nettoyer le dossier comptable des anomalies historiques.
Le multiple de cession appliqué en 2026 est de ×7,24 fois l'EBE retraité. Gagner 1 point d'EBE par un retraitement légitime peut valoir 50 000 € à 80 000 € de plus à la signature. À l'inverse, présenter un dossier flou ou non audité ouvre la porte à des négociations à la baisse et à des clauses de garantie d'actif et de passif (GAP) très défavorables.
03 Avant la signature d'une acquisition d'officine
L'audit d'acquisition (ou due diligence) est le miroir du précédent. Côté acquéreur, l'objectif est de vérifier la rentabilité réelle de l'officine ciblée, de détecter les risques fiscaux et sociaux cachés (TVA mal ventilée, tiers-payant fragile, redressement potentiel) et de chiffrer les écarts par rapport aux comptes présentés par le vendeur.
Le rapport sert d'outil de négociation chiffré entre les parties. L'expérience montre que l'audit acquisition permet de négocier en moyenne 5 à 15 % du prix d'acquisition, soit plusieurs dizaines de milliers d'euros sur une transaction type officine. Le retour sur investissement est immédiat, et la sécurité juridique sur le protocole l'est tout autant.
Notre conviction. Aucun pharmacien n'achèterait une voiture à 100 000 € sans contrôle technique. Et pourtant, beaucoup signent l'achat d'une officine à 1,5 M€ sur la seule foi des comptes présentés par le vendeur, sans audit indépendant. C'est la zone d'amélioration la plus rentable du marché.
04 Avant un contrôle fiscal ou une restructuration
Le quatrième moment-clé est plus défensif. Un audit fiscal préventif permet de sécuriser vos déclarations sur les points sensibles propres à l'officine : ventilation TVA multi-taux (2,1 / 10 / 20 %), traitement du tiers-payant, cohérence CVAE / CFE, qualification des charges, retraitement des charges mixtes (véhicule, téléphone, déplacements).
L'audit fiscal devient également indispensable au moment d'une restructuration : transformation d'une entreprise individuelle en SEL, apport de titres à une SPFPL, fusion de deux officines, intégration d'un nouvel associé. Dans tous ces cas, un audit indépendant fiabilise les valeurs d'apport, sécurise les opérations juridiques et permet d'anticiper les questions de l'administration fiscale.
Nos missions d'audit sont dimensionnées au plus près du besoin : nous ne facturons pas un audit complet quand un audit ciblé suffit. Et nous travaillons avec votre avocat et votre notaire pour que les conclusions de l'audit produisent leurs effets juridiques au bon moment.
Lequel de ces 4 moments concerne votre officine ?
30 minutes pour identifier le périmètre d'audit pertinent et le calendrier le plus efficace.
Comment un audit pré-cession a sécurisé 180 K€ de valorisation.
La situation et les chiffres sont strictement représentatifs d'une mission-type d'audit contractuel pré-cession sur ce profil d'officine.
Pharmacie en SELARL, titulaire en préparation de cession à 18 mois.
SELARL avec un EBE publié de 9,2 %, en dessous de la moyenne du secteur. Comptes historiquement tenus correctement mais sans retraitement, ni mise en valeur des charges exceptionnelles ou rémunération atypique du titulaire.
Audit pré-cession complet sur 3 exercices : retraitement de la rémunération, isolation des charges non récurrentes, fiabilisation des marges par famille, valorisation indépendante au multiple EBE retraité.
EBE retraité ressorti à 10,8 % au lieu de 9,2 %. Dossier audité présenté aux 3 repreneurs en compétition, signature à 180 K€ au-dessus de la valorisation initiale envisagée par le cédant.
Tout savoir sur l'audit et le commissariat aux comptes pharmacie.
Les questions concrètes que se posent les pharmaciens titulaires avant de commander une mission d'audit ou de nommer un commissaire aux comptes.
À partir de quand mon officine doit-elle nommer un commissaire aux comptes ?
La nomination d'un commissaire aux comptes est obligatoire pour les SELARL et SELAS dès qu'elles dépassent 2 des 3 seuils sur 2 exercices consécutifs : total bilan supérieur à 5 millions d'euros, chiffre d'affaires HT supérieur à 10 millions d'euros, et plus de 50 salariés.
En pratique pour une officine, le seuil de CA est rarement atteint en solo : il concerne principalement les grandes officines, les regroupements et les structures détenant plusieurs SEL via une SPFPL. La nomination du CAC se fait par décision de l'Assemblée Générale pour un mandat de 6 exercices.
Quelle différence entre expert-comptable et commissaire aux comptes ?
L'expert-comptable tient et établit vos comptes : il enregistre les opérations, produit le bilan, le compte de résultat et la liasse fiscale. Il est votre partenaire au quotidien et son rôle est d'établir les états financiers selon les règles comptables et fiscales.
Le commissaire aux comptes intervient ensuite pour contrôler ces états financiers. Il vérifie leur sincérité, leur régularité et leur image fidèle, puis émet un rapport d'audit présenté à l'Assemblée Générale. Pour des raisons d'indépendance déontologique, l'expert-comptable et le commissaire aux comptes d'une même entité ne peuvent pas appartenir au même cabinet.
Faut-il faire un audit pré-cession même si l'officine va bien ?
Oui, et c'est même dans ce cas que l'audit pré-cession est le plus rentable. Beaucoup de pharmaciens pensent à tort que leur officine "se vend toute seule" parce qu'elle est bien tenue. En réalité, le repreneur et son banquier retraitent systématiquement vos comptes à la baisse, par prudence et par négociation.
L'audit pré-cession permet d'anticiper ces retraitements et de présenter d'emblée un EBE retraité défendable, valorisé, accompagné de la documentation justificative. Sur une cession à 1,5 M€, gagner 1 point d'EBE peut valoir 50 000 à 80 000 € au prix de signature. Le retour sur investissement est immédiat.
Combien de temps faut-il pour réaliser un audit d'officine ?
Pour une mission de CAC annuelle, comptez 4 à 6 semaines entre la collecte des pièces et la remise du rapport. La mission s'étale en pratique sur l'exercice et donne lieu à des interventions ponctuelles tout au long de l'année (intérim, contrôle des comptes annuels).
Pour un audit contractuel ponctuel (pré-cession, due diligence, audit interne), comptez 2 à 4 semaines selon le périmètre. Le délai dépend principalement de la disponibilité de votre documentation comptable : plus vos pièces sont organisées, plus l'audit est rapide.
Que se passe-t-il si je ne nomme pas de CAC alors que je devrais ?
L'absence de nomination d'un CAC alors que les seuils sont atteints constitue une infraction au Code de commerce. Concrètement, le greffe du tribunal de commerce peut refuser le dépôt des comptes annuels, le président du tribunal peut désigner d'office un CAC à votre charge, et la responsabilité du dirigeant peut être engagée pour faute de gestion.
Plus pragmatiquement, en cas de cession ou de prise de participation, l'absence d'audit historique est presque toujours détectée par les acquéreurs et leurs conseils. C'est un point qui dégrade la valorisation et fragilise la sécurité juridique de l'opération. Anticiper la nomination du CAC est toujours préférable à la subir dans l'urgence.
Peut-on auditer une officine en entreprise individuelle ?
Oui, sans aucun obstacle. L'obligation légale du commissariat aux comptes ne concerne pas les entreprises individuelles (les seuils ne s'y appliquent pas), mais cela n'empêche en aucun cas un pharmacien en exercice individuel de commander un audit contractuel ou volontaire.
Au contraire, l'audit volontaire est particulièrement utile pour les pharmaciens en EI qui préparent une transformation en SEL, un projet d'acquisition, une transmission ou simplement un check-up de gestion. L'audit fournit alors une photographie indépendante de la situation comptable, fiscale et patrimoniale, utile pour toute décision stratégique.
Comment se passe le choix du commissaire aux comptes ?
Le commissaire aux comptes est nommé par décision de l'Assemblée Générale des associés sur proposition du dirigeant. Le choix doit respecter le principe d'indépendance déontologique : le CAC ne peut pas être l'expert-comptable de la même entité, ni avoir d'intérêts financiers ou personnels avec le dirigeant ou les associés.
Notre approche est de vous proposer un commissaire aux comptes spécialisé pharmacie d'officine, capable de comprendre les spécificités de votre secteur (TVA multi-taux, tiers-payant, IDCC 1996, marges réglementées, montages SEL/SPFPL). Cela évite les questions de base et permet une mission d'audit réellement utile, pas une simple formalité administrative.
Parlons de votre officine.
Un échange court pour comprendre votre situation et vous proposer une mission adaptée. Vous repartez avec des pistes concrètes, même si vous ne devenez pas client.